ダウンロードした型紙を印刷した際にサイズ確認用の長さが5cmにならない場合、印刷時の設定やプリンターの余白等で自動的に少し縮小されて印刷されているのではないかと思われます。

100%等で印刷すると、プリンターの余白などでずれる場合があります。
Acrobat Readerでの印刷時に「実際のサイズ」を選択して印刷することで、プリンターの余白等で自動で縮小されずに印刷されることはなくなるかと思います。